Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms