Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SYNMO15061 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYNMO15061 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SYNMO15061 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms