Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPRTO14522 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPRTO14522 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
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