Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QRK9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QRK9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QRK9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
J3QRK9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
J3QRK9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
J3QRK9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
J3QRK9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
J3QRK9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms