Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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