Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
E9PCH4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E9PCH4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E9PCH4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E9PCH4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E9PCH4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E9PCH4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
E9PCH4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms