Protein–RNA interactions for Protein: A8MTL9

HMSD, Serpin-like protein HMSD, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMSDA8MTL9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMSDA8MTL9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms