Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L4A6NCW7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms