Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC4A4Q9Y6R1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A4Q9Y6R1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms