Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA3Q9Y6H8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA3Q9Y6H8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms