Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRXN3Q9Y4C0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms