Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG6Q9Y2V7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG6Q9Y2V7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms