Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINLQ9Y2I6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINLQ9Y2I6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms