Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNNQ9UQP3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNQ9UQP3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms