Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
AGTPBP1Q9UPW5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AGTPBP1Q9UPW5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
AGTPBP1Q9UPW5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms