Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
USP18Q9UMW8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
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