Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCN11AQ9UI33 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms