Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLKQ9UBT6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLKQ9UBT6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms