Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DKK3Q9UBP4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms