Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms