Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHPF2Q9P2E5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHPF2Q9P2E5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms