Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VNN3Q9NY84 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms