Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLE1Q9NVX2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms