Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLE3Q9NRF9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLE3Q9NRF9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms