Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
BATF3Q9NR55 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms