Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FSCN3Q9NQT6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms