Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXQ1Q9C009 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms