Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHANK3Q9BYB0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms