Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EFHD1Q9BUP0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms