Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYD88Q99836 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms