Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GFI1Q99684 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GFI1Q99684 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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GFI1Q99684 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GFI1Q99684 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GFI1Q99684 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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GFI1Q99684 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GFI1Q99684 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GFI1Q99684 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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