Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EYA3Q99504 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms