Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ALS2Q96Q42 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms