Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC74BQ96LY2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC74BQ96LY2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms