Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCORQ96JN0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms