Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LMO7Q8WWI1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO7Q8WWI1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms