Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RHBDD1Q8TEB9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms