Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNBD1Q8NA66 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNBD1Q8NA66 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms