Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms