Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HECW1Q76N89 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HECW1Q76N89 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms