Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGD6Q6ZV73 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FGD6Q6ZV73 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms