Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZS62

COLCA1, Colorectal cancer-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA1Q6ZS62 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COLCA1Q6ZS62 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms