Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSK4Q6SA08 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms