Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms