Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATL3Q6DD88 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms