Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SUSD4Q5VX71 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUSD4Q5VX71 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms