Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF20Q5VTR2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF20Q5VTR2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms