Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms