Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CC2D1BQ5T0F9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms