Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDCA8Q53HL2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDCA8Q53HL2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms